在上海設(shè)有男科的公立醫(yī)院中，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院是知名三甲醫(yī)院。
上海市男科學(xué)研究所的工作始于20世紀(jì)60年代，是我國(guó)最早開(kāi)展男科工作的臨床機(jī)構(gòu)之一。經(jīng)過(guò)幾代專(zhuān)家教授的共同努力，于2001年12月由上海市衛(wèi)生局正式批準(zhǔn)成立上海市男科學(xué)研究所，同年批準(zhǔn)設(shè)立了SFDA藥物臨床研究基地；2007年成為上海仁濟(jì)醫(yī)院第三期特色學(xué)科（專(zhuān)業(yè)）；2008年起正式成為教育部211工程建設(shè)重點(diǎn)學(xué)科（泌尿男科）；2012年獲得衛(wèi)生部重點(diǎn)專(zhuān)科在建（男科是重點(diǎn)建設(shè)的兩個(gè)方向之一）。
男科疾病臨床診療規(guī)范化程度位居國(guó)內(nèi)領(lǐng)先水平，2012年負(fù)責(zé)編寫(xiě)《中華醫(yī)學(xué)會(huì)男性不育診療指南（2013版）》，尤其是無(wú)精子癥規(guī)范化診療流程，受到國(guó)際同行的關(guān)注。其他診療特色包括男性勃起功能障礙的早期診治、早泄的規(guī)范化診療、不射精癥的特色治療、陰莖發(fā)育異常（包莖、隱匿陰莖、陰莖彎曲等）、中老年男性激素分泌異常、前列腺疾病、青春期發(fā)育遲滯、夫妻性健康教育、青少年生殖健康指導(dǎo)等。
每周一至周五全天開(kāi)設(shè)普通門(mén)診，另有專(zhuān)家門(mén)診及特需門(mén)診。常規(guī)開(kāi)展包括顯微取精術(shù)、顯微外科精索靜脈結(jié)扎術(shù)、顯微外科輸精管道重建術(shù)、精囊鏡探查術(shù)、包皮整形術(shù)、陰莖假體植入術(shù)以及尿道下裂修復(fù)等在內(nèi)的所有男科手術(shù)。
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